常熟市食品藥品監督管理局,為常熟市政府工作部門,正科級建制,與常熟市衛生局合署辦公,負責全市藥品、醫療器械、保健食品、化妝品和餐飲服務環節食品監督管理等十一項職責。前身為2001年10月成立的蘇州市常熟藥品監督管理局,2005年6月更名為蘇州市常熟食品藥品監督管理局,2010年機構改革,由省以下垂直管理改為由地方政府管理,更名為常熟市食品藥品監督管理局。設8個內設機構,其中綜合科室4個,分別是黨政辦公室、人事科教科、法規科(行政許可服務科)、規劃財務科,與常熟市衛生局綜合設置;業務科室4個,分別是綜合科、藥械監管科、餐飲監管科(保健食品化妝品監管科)、藥品稽查科(市藥品監督稽查大隊),均為正股級建制。派駐紀檢組、室(合署辦公)與常熟市衛生局綜合設置。下屬事業單位有常熟市藥品檢驗所。經常熟市食品藥品監督管理局授權,常熟市衛生監督所承擔全市餐飲服務食品日常監管職責。